More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0208 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
500 aa  1036    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  55.53 
 
 
496 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  55.53 
 
 
496 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  43.89 
 
 
490 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  43.89 
 
 
490 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  26.71 
 
 
513 aa  194  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  27.31 
 
 
541 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  26.1 
 
 
548 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  25.39 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  26.6 
 
 
500 aa  159  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  26.84 
 
 
506 aa  133  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
501 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  27.84 
 
 
743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
363 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  33.7 
 
 
353 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0011  glycosyltransferase  22.18 
 
 
490 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
394 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 
502 aa  99.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  23.27 
 
 
503 aa  99.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.37 
 
 
502 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
353 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
440 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  25.72 
 
 
481 aa  97.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
660 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
375 aa  97.1  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
409 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.14 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
388 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
368 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
386 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  25.19 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  25.19 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  28.42 
 
 
416 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
412 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
364 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
380 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  26.4 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  27.07 
 
 
378 aa  87.4  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
365 aa  87.4  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 
808 aa  87  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
890 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
355 aa  86.7  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  31.03 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  24.22 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.6 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  24.73 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  23.53 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
669 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.11 
 
 
383 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
678 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.75 
 
 
386 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  29.07 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  24.44 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  28.91 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  30.06 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
413 aa  72  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  24.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>