More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02595 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  100 
 
 
382 aa  796    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 
384 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
381 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  32.55 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.72 
 
 
383 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.05 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
770 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.88 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
408 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
374 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.72 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
414 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
377 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
382 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
376 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
384 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
415 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
376 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
386 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
399 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
377 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 
378 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  24.86 
 
 
384 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
379 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.36 
 
 
349 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
389 aa  102  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
426 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
362 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
427 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
430 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  27.51 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  25.09 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  24.37 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
378 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
352 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
340 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.18 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.18 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
392 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 
466 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
357 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
810 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
482 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.67 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
448 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.91 
 
 
770 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  29.46 
 
 
434 aa  89.7  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  25.71 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
450 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  26.87 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.01 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  26.76 
 
 
424 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
348 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  30.09 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>