More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1357 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 364 aa  740    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  48.79 
 
 		 409 aa  345  8e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  28.88 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 660 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 808 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.6 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.3 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 890 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  30.19 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.4 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.13 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  29.43 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  28.21 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.15 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.94 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.86 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 762 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  27.71 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.2 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.14 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  29.58 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.38 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.38 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.92 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  27.64 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  28.73 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  30.34 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 393 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  27.27 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  27.36 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  32.02 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  27.9 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 669 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  25.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>