More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2467 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
412 aa  836    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  89.32 
 
 
412 aa  744    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
377 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
378 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
381 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
385 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
383 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.89 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
371 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.79 
 
 
745 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
345 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
380 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
385 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.54 
 
 
745 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 
371 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
395 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  28.91 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
350 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  28.57 
 
 
350 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.02 
 
 
359 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.91 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
390 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
367 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.55 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.2 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.94 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.41 
 
 
366 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.1 
 
 
373 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.44 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.44 
 
 
366 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.44 
 
 
366 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
375 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
439 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
413 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
378 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
365 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
391 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
389 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
384 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
440 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
390 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
360 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
379 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
399 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  31.9 
 
 
379 aa  106  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
402 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.52 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
453 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
366 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
388 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  27.57 
 
 
350 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  26.78 
 
 
371 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
376 aa  104  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  26.51 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
360 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
403 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.4 
 
 
383 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
403 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
373 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
367 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
398 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
765 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
391 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
373 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
384 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
363 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.67 
 
 
401 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
375 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
503 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
370 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  31.01 
 
 
822 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>