More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1793 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  793    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
370 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
384 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
387 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
386 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
394 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
372 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
355 aa  133  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  27.86 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
373 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
379 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
378 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
351 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
364 aa  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
391 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
399 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
361 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
398 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
377 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.59 
 
 
411 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
381 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
364 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
385 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
379 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
391 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
390 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.6 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 
365 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.39 
 
 
373 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
379 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
371 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.04 
 
 
346 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
371 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
387 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
413 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
364 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.42 
 
 
369 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
399 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.23 
 
 
419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
346 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
377 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
385 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  36.32 
 
 
372 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
384 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
378 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
373 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
369 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
364 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
236 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
390 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
439 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
374 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
381 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.87 
 
 
369 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
376 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
402 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.01 
 
 
366 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
412 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.57 
 
 
371 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
398 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
395 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
380 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
353 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.03 
 
 
401 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
370 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
378 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
359 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
370 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
373 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
396 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
345 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
383 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
387 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
377 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
390 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
388 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>