More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2648 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 391 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  41.81 
 
 		 371 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 		 379 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 392 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 		 385 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  34.62 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 378 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 384 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 383 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 		 386 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 388 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 412 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 387 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 412 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 391 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 822 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 370 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 512 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 439 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 380 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 371 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 378 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 391 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  40.22 
 
 		 411 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  32.38 
 
 		 430 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 		 427 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.28 
 
 		 401 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 372 aa  86.3  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 381 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  37.36 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  31.22 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 463 aa  82  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.67 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 1080 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 763 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 765 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.08 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.81 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  28.97 
 
 		 507 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 393 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.85 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.82 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  28.9 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.67 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.74 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 360 aa  72  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 378 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 387 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 379 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  29.02 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>