More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  90.78 
 
 		 500 aa  926    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  57.64 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  55.82 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  53.57 
 
 		 537 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  52.48 
 
 		 550 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  53.17 
 
 		 540 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  54.77 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  53.61 
 
 		 529 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  51.68 
 
 		 550 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  51.19 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  51.11 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  52.29 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  50.3 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  49.9 
 
 		 518 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  51.7 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  51.09 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  47.9 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  49.01 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  43.03 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  46 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  40.61 
 
 		 502 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  40.4 
 
 		 503 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 570 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  38.91 
 
 		 516 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  33.27 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 		 473 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  33.87 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  34.24 
 
 		 606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 487 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  27.52 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 360 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 372 aa  93.2  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 412 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 373 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 385 aa  90.1  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 412 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 371 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.22 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  30 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 765 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 236 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  35.44 
 
 		 2822 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 822 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>