More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0994 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
471 aa  953    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  42.89 
 
 
463 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  39.96 
 
 
468 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
502 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
570 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  35.53 
 
 
467 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.69 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
473 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
504 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  30.83 
 
 
503 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  42.64 
 
 
412 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  33.27 
 
 
507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  31.36 
 
 
550 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
550 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  32.93 
 
 
500 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
505 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
526 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
527 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
503 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
507 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
518 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  29.88 
 
 
529 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
540 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
537 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
503 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
510 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  28.07 
 
 
529 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
516 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
512 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  34.59 
 
 
606 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
505 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
500 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
568 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
487 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  21.58 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
396 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
387 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
362 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
399 aa  90.1  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
361 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
377 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  35.88 
 
 
2880 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
364 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
377 aa  87  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
379 aa  87  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
426 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
385 aa  86.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
348 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.81 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.23 
 
 
372 aa  84  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
360 aa  84  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
412 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  28.3 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  22.12 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.25 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  25.92 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.26 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  29.75 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
379 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  28.3 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>