More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2668 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
502 aa  1023    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  41.13 
 
 
512 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  43.03 
 
 
570 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  39.92 
 
 
503 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  40.61 
 
 
507 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
505 aa  358  9e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  39.92 
 
 
518 aa  355  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 
550 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
503 aa  348  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  37.3 
 
 
550 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  39.04 
 
 
529 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  39.6 
 
 
500 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
526 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 
510 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  36.58 
 
 
538 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  38.8 
 
 
540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  39.44 
 
 
537 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
527 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
512 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  38.78 
 
 
529 aa  329  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
507 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 
471 aa  320  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
503 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
463 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
468 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
473 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.95 
 
 
473 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  35.9 
 
 
503 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  31.81 
 
 
467 aa  259  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  39.69 
 
 
606 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
568 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
505 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
500 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  28.45 
 
 
486 aa  151  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  27.77 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
372 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
398 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
374 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
379 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
412 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
382 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
412 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
360 aa  90.9  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
395 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
413 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
394 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.17 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.53 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  29.25 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.66 
 
 
745 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  29.25 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
365 aa  79  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  29.25 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
381 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
476 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
404 aa  77  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
378 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.46 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.15 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
379 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.92 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
399 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.89 
 
 
372 aa  76.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>