More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5285 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  72.12 
 
 
529 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  72.92 
 
 
537 aa  762    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
527 aa  1088    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  73.52 
 
 
540 aa  767    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  62.82 
 
 
538 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  61.67 
 
 
550 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  62.26 
 
 
550 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  72.82 
 
 
529 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  59.88 
 
 
512 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  58.84 
 
 
507 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  58.32 
 
 
518 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  59.24 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  55.62 
 
 
505 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  53.69 
 
 
503 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  54.18 
 
 
512 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  51.93 
 
 
526 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  51.09 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  51.89 
 
 
500 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  50.1 
 
 
503 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  45.55 
 
 
504 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
502 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
570 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  36.45 
 
 
503 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
471 aa  276  6e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.13 
 
 
473 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.47 
 
 
473 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
516 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  32.73 
 
 
467 aa  237  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 
463 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
412 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
500 aa  173  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  36.33 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
568 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
505 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
487 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.55 
 
 
486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
372 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
398 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
395 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
406 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
388 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
381 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
386 aa  77  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
382 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.28 
 
 
822 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  27.71 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
387 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
384 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  28.17 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
417 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00194  hexosyltransferase  41.01 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  27.49 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
375 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  27.49 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
1080 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>