More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3201 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
505 aa  1038    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  63.47 
 
 
503 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  56.09 
 
 
540 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  53.25 
 
 
538 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  55.69 
 
 
537 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  53.63 
 
 
550 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  55.58 
 
 
510 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  54.33 
 
 
512 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  53.29 
 
 
507 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  53.01 
 
 
550 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  55.87 
 
 
529 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  54.51 
 
 
529 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  55.62 
 
 
527 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  52.26 
 
 
518 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  46.32 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  49.9 
 
 
526 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  46.39 
 
 
503 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  49.01 
 
 
507 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  48.88 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  46.17 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
502 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  36.47 
 
 
503 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 
570 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 
473 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 
473 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
471 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  33.54 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
516 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
463 aa  226  6e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  32.17 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
568 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
505 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
500 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 
487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  26.8 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
348 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
372 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
402 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.48 
 
 
371 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
398 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
406 aa  94.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.37 
 
 
350 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
398 aa  86.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  31.02 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
374 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
391 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.91 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.22 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.78 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
423 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
367 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
439 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
408 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  31.22 
 
 
2822 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
374 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
367 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.31 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.05 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>