More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1833 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  62.33 
 
 
529 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
538 aa  1098    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  75.7 
 
 
550 aa  824    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  65.21 
 
 
537 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  76.16 
 
 
550 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  62.76 
 
 
529 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  65.81 
 
 
540 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  62.82 
 
 
527 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  53.14 
 
 
507 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  53.25 
 
 
505 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  56.49 
 
 
518 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  56.94 
 
 
512 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  56.46 
 
 
510 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  52.31 
 
 
503 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  52.07 
 
 
512 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  48.62 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  48.83 
 
 
526 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  52.41 
 
 
500 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  51.11 
 
 
507 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  44.75 
 
 
504 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  48.89 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  36.58 
 
 
502 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
570 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  37.67 
 
 
503 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
471 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
516 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.59 
 
 
473 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.59 
 
 
473 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  31.49 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
463 aa  237  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
468 aa  230  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
412 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  37.01 
 
 
606 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
500 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
568 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
487 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.83 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
395 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
385 aa  87  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
391 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  23.5 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  22.65 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
414 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.3 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.63 
 
 
822 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
1080 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
386 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
412 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  24.34 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  22.22 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00194  hexosyltransferase  31.94 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.37 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
406 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
409 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>