More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1626 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
516 aa  1039    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  45.95 
 
 
503 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  41.48 
 
 
570 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 
526 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  39.24 
 
 
500 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  38.91 
 
 
507 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  36.11 
 
 
550 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
540 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
537 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
518 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
538 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
503 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.64 
 
 
473 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.64 
 
 
473 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
507 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  36.23 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
512 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  36.88 
 
 
529 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
527 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 
503 aa  267  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  34.72 
 
 
467 aa  267  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
512 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
505 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
510 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  33.4 
 
 
504 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
471 aa  251  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
463 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
412 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
568 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  34.87 
 
 
606 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
500 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
505 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  26.29 
 
 
486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
487 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
765 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
360 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
372 aa  93.6  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
391 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
763 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
404 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
1080 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  26.36 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  31.55 
 
 
745 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.11 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.62 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  22.66 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.36 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>