More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1496 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  75.7 
 
 
538 aa  840    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  60.7 
 
 
527 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  63.35 
 
 
529 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  65.29 
 
 
537 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  64.06 
 
 
540 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
550 aa  1131    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  93.09 
 
 
550 aa  1059    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  63.6 
 
 
529 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  55.51 
 
 
518 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  58 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  54.53 
 
 
507 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  57.23 
 
 
512 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  53.82 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  51.51 
 
 
503 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  52.48 
 
 
507 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  52.13 
 
 
512 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  52.43 
 
 
500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  48.51 
 
 
503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  48.9 
 
 
526 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  44.47 
 
 
504 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  48.31 
 
 
503 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
502 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.06 
 
 
570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  38.22 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 
471 aa  276  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
516 aa  270  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.66 
 
 
473 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.39 
 
 
473 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  32.79 
 
 
467 aa  252  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
468 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
463 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
412 aa  206  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
568 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  36.58 
 
 
606 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
500 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  24.3 
 
 
486 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
385 aa  90.1  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
1080 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
380 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
419 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  24.15 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  24.58 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
387 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  23.53 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
381 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
378 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  21.29 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  22.69 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.32 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
396 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 
359 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.06 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  21.94 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
372 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
236 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  21.85 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>