More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  100 
 
 
486 aa  970    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  41.14 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
505 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  25.05 
 
 
463 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  25.05 
 
 
468 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
502 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  21.58 
 
 
471 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
512 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
504 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
503 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.86 
 
 
473 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.86 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  27.52 
 
 
507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  27.63 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
526 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  27.27 
 
 
500 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
518 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
503 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
540 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  24.46 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
510 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  24.46 
 
 
550 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  26.53 
 
 
529 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
570 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
550 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
412 aa  107  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
503 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
385 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
527 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  29.51 
 
 
503 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
381 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
391 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
399 aa  93.2  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
568 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  25.09 
 
 
606 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
370 aa  90.1  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
387 aa  90.1  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.86 
 
 
382 aa  87  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
437 aa  87  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
385 aa  87  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
808 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
904 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  24.84 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
370 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
339 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  24.84 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.84 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
423 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
391 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
376 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.1 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.75 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.85 
 
 
745 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  20.75 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
750 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.34 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.26 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.87 
 
 
822 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
660 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>