More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2271 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  62.33 
 
 		 538 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1084    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  89.03 
 
 		 540 aa  952    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  72.12 
 
 		 527 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  90.78 
 
 		 537 aa  944    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  63.53 
 
 		 550 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  64.1 
 
 		 550 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  74.48 
 
 		 529 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  58.22 
 
 		 518 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  58.51 
 
 		 512 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  55.4 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  58.4 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  56.34 
 
 		 507 aa  585  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  54.51 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  54.07 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  53.61 
 
 		 507 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  51.39 
 
 		 526 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  53.02 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  48.61 
 
 		 503 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  42.57 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  49.3 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 		 502 aa  346  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 		 570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  37.8 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  36.03 
 
 		 516 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.13 
 
 		 473 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.2 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 471 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  32.59 
 
 		 467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 412 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  36.72 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.05 
 
 		 568 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 505 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  27.83 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 487 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 385 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  31.49 
 
 		 822 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.77 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 765 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  23.99 
 
 		 2822 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 1080 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.92 
 
 		 406 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  22.46 
 
 		 378 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  21.61 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  24.16 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>