More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4076 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  100 
 
 		 503 aa  1003    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  41.94 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 		 516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  38.6 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  40.04 
 
 		 507 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 505 aa  309  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 		 538 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  39.33 
 
 		 529 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 		 507 aa  302  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  38.55 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  37.45 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 518 aa  290  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 504 aa  286  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  37.92 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 537 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 527 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 540 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 503 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.53 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.53 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 503 aa  253  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  31.34 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 568 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  33.46 
 
 		 606 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 372 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 391 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  33.16 
 
 		 822 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 415 aa  87  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 381 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 409 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.11 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  30.43 
 
 		 2880 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.2 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.68 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.26 
 
 		 935 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.96 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.75 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.6 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>