More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4566 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 371 aa  749    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  32.55 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  41.81 
 
 		 236 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  30.46 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.81 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.93 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  32.27 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  29 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  27.74 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  31.94 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  31.94 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.12 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  33.54 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  33.54 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  28.06 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  30.34 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  30.56 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2215  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.645202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.62 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.91 
 
 		 822 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  32.3 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  24.7 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  37.61 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.42 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.85 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 765 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>