More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2970 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  64.1 
 
 
529 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  93.09 
 
 
550 aa  1040    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  76.16 
 
 
538 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  100 
 
 
550 aa  1131    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  64.17 
 
 
529 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  66.47 
 
 
537 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  61.28 
 
 
527 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  67.26 
 
 
540 aa  698    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  55.71 
 
 
518 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  56.74 
 
 
512 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  54.72 
 
 
507 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  56.4 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  53.63 
 
 
505 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  51.61 
 
 
503 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  52.51 
 
 
512 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  49.4 
 
 
503 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  52.54 
 
 
500 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  49.1 
 
 
526 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  51.68 
 
 
507 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  44.96 
 
 
504 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  48.31 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
502 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
570 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  38.34 
 
 
503 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
471 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
516 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.25 
 
 
473 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.25 
 
 
473 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  32.59 
 
 
467 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
468 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
463 aa  243  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
412 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
500 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  36.96 
 
 
606 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
568 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
505 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
487 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  24.46 
 
 
486 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
385 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
398 aa  88.6  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
381 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
1080 aa  83.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
392 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
393 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
370 aa  77  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  24.05 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.48 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
763 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.31 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  21.29 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
378 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
408 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
402 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
398 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
765 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.18 
 
 
745 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
411 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.19 
 
 
822 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
438 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
373 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
380 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>