More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1140 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 386 aa  758    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  41 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.12 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 819 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 822 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 821 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 821 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  32.01 
 
 		 820 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  31.58 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 818 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 828 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  32.76 
 
 		 820 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.23 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.36 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.74 
 
 		 857 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.39 
 
 		 745 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.15 
 
 		 856 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.15 
 
 		 856 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  32.15 
 
 		 820 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.15 
 
 		 820 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.15 
 
 		 820 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  30.5 
 
 		 383 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  31.86 
 
 		 820 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.57 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.86 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  41.99 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  34.09 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.04 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.6 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 660 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 765 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 426 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  24.34 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>