More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1580 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 380 aa  740    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.32 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  35.31 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 828 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 818 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  34.28 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 821 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  33.08 
 
 		 820 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 822 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 819 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 856 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 856 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  34.93 
 
 		 820 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.8 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 820 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 		 820 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.13 
 
 		 857 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  34.63 
 
 		 820 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 821 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 821 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 821 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 821 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.38 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2365  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0471008  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.27 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  25 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 418 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  26.27 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.79 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  33.7 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.66 
 
 		 745 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  33.82 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.17 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  32.4 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 743 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.7 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.09 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  35.67 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  28.9 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  28.57 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>