More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2978 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  100 
 
 
360 aa  724    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  53.12 
 
 
340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
368 aa  352  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  48.07 
 
 
364 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  47.29 
 
 
377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  43.58 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  42.47 
 
 
402 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
386 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
365 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  38.68 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  39.94 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
354 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
354 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
354 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
373 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
354 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
354 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
354 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
365 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
354 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  36.24 
 
 
357 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
355 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
354 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
336 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 
373 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 
355 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
355 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
336 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  37.5 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.26 
 
 
376 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
354 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  37.83 
 
 
353 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  38.75 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  36.16 
 
 
356 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
355 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
355 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
364 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
370 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 
354 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
354 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
354 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
354 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
354 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  37.28 
 
 
360 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
354 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
379 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
344 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
362 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.65 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 
354 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
354 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
372 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  36.39 
 
 
354 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
354 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
354 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
400 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
339 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
354 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  35.17 
 
 
355 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  37.64 
 
 
361 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
355 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
376 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
408 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
354 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 
363 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
417 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
343 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>