More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1149 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  758    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  46.34 
 
 
383 aa  339  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 
378 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.88 
 
 
413 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  47.17 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 
383 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  44.94 
 
 
818 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  45.19 
 
 
820 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  47.64 
 
 
820 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  45.69 
 
 
828 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.45 
 
 
856 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.45 
 
 
856 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  47.63 
 
 
821 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.45 
 
 
820 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.45 
 
 
820 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  50.45 
 
 
820 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  46.84 
 
 
821 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.85 
 
 
857 aa  272  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  46.32 
 
 
819 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  50.15 
 
 
820 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  46.97 
 
 
821 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  46.97 
 
 
821 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  46.97 
 
 
821 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  45.79 
 
 
822 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 
408 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  49.27 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
386 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
399 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
432 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
393 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
377 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  24.6 
 
 
379 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  35.48 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
381 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
401 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
364 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 
370 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
398 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
379 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
383 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
364 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 
366 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
388 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
385 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
398 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
406 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.1 
 
 
419 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
376 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
360 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.33 
 
 
745 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
371 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
392 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  41.08 
 
 
382 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
360 aa  103  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.98 
 
 
395 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
382 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
383 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
388 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
389 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  40.49 
 
 
379 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
426 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
374 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
381 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
453 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.42 
 
 
745 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.95 
 
 
346 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.16 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.33 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  26.23 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 
405 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  29.06 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
398 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
345 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
419 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>