More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4018 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
828 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
384 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  27.37 
 
 
820 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
818 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  25.81 
 
 
820 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
856 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  27.06 
 
 
820 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
856 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  28.53 
 
 
820 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
820 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
820 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
821 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
389 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
398 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  25.06 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
819 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
821 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
413 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
857 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
822 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.39 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
821 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
821 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
821 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
408 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
750 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0857  a-glycosyltransferase  25.43 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  22.96 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
382 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  23.72 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  31.06 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
739 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01299  putative glycosyltransferase  22.65 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  36.63 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.61 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  31.06 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.24 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  27.43 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  27.6 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>