More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4575 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 413 aa  828    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.18 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 389 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.77 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 818 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  28.48 
 
 		 820 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 821 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  25.77 
 
 		 820 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 828 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 821 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  23.51 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 822 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  28.91 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 819 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  28.4 
 
 		 820 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  26.13 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 		 856 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  28.8 
 
 		 820 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 		 856 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 		 820 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 		 820 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.04 
 
 		 650 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.89 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  20.55 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.01 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.91 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.97 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 821 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  21.31 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.57 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.57 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.44 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.96 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>