More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2716 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  92.02 
 
 		 352 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 352 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  70.23 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  71.3 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  67.15 
 
 		 354 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  67.15 
 
 		 354 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  67.44 
 
 		 362 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  57.8 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  57.88 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  52 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  51.14 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  51.45 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  54.89 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  54.31 
 
 		 344 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  54.31 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  49.29 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.59 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.76 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  38.18 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.45 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.59 
 
 		 382 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 401 aa  93.2  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  34.41 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 426 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 403 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.98 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  36.07 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.8 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.76 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.45 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.32 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.83 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.51 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.02 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.3 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 819 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>