More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5673 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 348 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  49.42 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  49.71 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  50.29 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  50.29 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  49.13 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  49.12 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  48.12 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  43.52 
 
 		 352 aa  280  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  46.38 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  46.61 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  44.57 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  46.33 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  43.77 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  40.18 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  44.19 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.54 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  41.91 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  39.89 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.2 
 
 		 383 aa  99.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.66 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.42 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 810 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 403 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  32.7 
 
 		 398 aa  93.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.77 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.2 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 437 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 437 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.84 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 415 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.52 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 410 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 376 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 367 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 821 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 430 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 376 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.93 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.67 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  31.58 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>