More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03358 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 362 aa  751    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  70.95 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  62.82 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  48.57 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  38.33 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  38.82 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  38.82 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.08 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  36.29 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  37.65 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  39.89 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  39.4 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  36.29 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.92 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.51 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.57 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.05 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  27.91 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  26.35 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  29.05 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  22.69 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>