More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1349 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
387 aa  789    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  41 
 
 
386 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
818 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  28.69 
 
 
820 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.8 
 
 
468 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
381 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
821 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  30.97 
 
 
820 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
821 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
822 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
819 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
856 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
856 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
820 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
820 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  30.84 
 
 
820 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  30.54 
 
 
820 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
421 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
821 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
821 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
821 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
857 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
828 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
348 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
400 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 
373 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.09 
 
 
423 aa  93.2  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
378 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  30.64 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
360 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  23.97 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
413 aa  89.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
375 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
748 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  33.5 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
448 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
378 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
403 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.35 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.69 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.9 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.78 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
344 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  25.95 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.23 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.64 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  29.96 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.15 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  27.81 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  51.22 
 
 
550 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  33.85 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>