More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6757 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  100 
 
 
417 aa  819    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  72.99 
 
 
431 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  68.2 
 
 
448 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  69.75 
 
 
450 aa  534  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  66.99 
 
 
482 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  67.63 
 
 
439 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  64.82 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  67.87 
 
 
439 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  67.87 
 
 
439 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  66.51 
 
 
450 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  63.66 
 
 
458 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  65.3 
 
 
480 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  63.37 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  62.38 
 
 
438 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  63.81 
 
 
466 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  67.24 
 
 
442 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  64.29 
 
 
443 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.27 
 
 
435 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  65.14 
 
 
435 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  61.76 
 
 
458 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  62.09 
 
 
428 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  59.75 
 
 
434 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  62.32 
 
 
434 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  61.08 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  61.54 
 
 
429 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  61.08 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  58.78 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  59.81 
 
 
417 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  56.22 
 
 
420 aa  401  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  54.57 
 
 
418 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  53.2 
 
 
443 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  51.34 
 
 
420 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  51.09 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  41.97 
 
 
421 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 
423 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 
419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  40.88 
 
 
426 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  41.97 
 
 
421 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 
405 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
672 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  36.98 
 
 
419 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  42.65 
 
 
413 aa  223  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  42.59 
 
 
1169 aa  222  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
440 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
439 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.13 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.13 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.28 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.13 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.13 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.37 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.37 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
438 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
435 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  36.93 
 
 
442 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
434 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  32.76 
 
 
650 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
422 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 
430 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  35.89 
 
 
411 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
425 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
405 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
424 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.17 
 
 
423 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
453 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  33.41 
 
 
426 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  36.83 
 
 
415 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
405 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.72 
 
 
406 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
477 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
420 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.72 
 
 
403 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  37.61 
 
 
397 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
402 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
406 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  35.83 
 
 
407 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 
408 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
391 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
391 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>