More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0890 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  851    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  65.14 
 
 
417 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  63.35 
 
 
428 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  62.17 
 
 
427 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  61.05 
 
 
431 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  61.37 
 
 
458 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.2 
 
 
435 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  60.7 
 
 
431 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  61.84 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  58.91 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  59.86 
 
 
448 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  61.18 
 
 
417 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  59.1 
 
 
482 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  59.29 
 
 
480 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  58.53 
 
 
434 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  58.55 
 
 
424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  59.39 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  59.13 
 
 
466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  58.16 
 
 
450 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  56.37 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  56.47 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  58.02 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  58.95 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  55.37 
 
 
438 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  60.1 
 
 
435 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  58.47 
 
 
439 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  58.47 
 
 
439 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  56.32 
 
 
448 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  57.04 
 
 
429 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  53.19 
 
 
418 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  53.12 
 
 
443 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  50.84 
 
 
420 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  52.28 
 
 
421 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
419 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
421 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
423 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
426 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  43.75 
 
 
413 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
434 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  38.28 
 
 
411 aa  226  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.78 
 
 
405 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
440 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 
425 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
419 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
405 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
424 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
422 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
438 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32 
 
 
423 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
435 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
439 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
495 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
499 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
498 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
443 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
443 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
439 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
439 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
672 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 
426 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  40.23 
 
 
1169 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 
405 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  35.7 
 
 
438 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.87 
 
 
426 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
477 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.98 
 
 
650 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
406 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
430 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  34.99 
 
 
442 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  38.39 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  38.31 
 
 
406 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
420 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35 
 
 
403 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
415 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.23 
 
 
407 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
418 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 
408 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 
408 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  34.61 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
393 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
396 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.93 
 
 
388 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>