More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2900 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
421 aa  851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  81.01 
 
 
420 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  50.24 
 
 
448 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  51.35 
 
 
466 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  51.09 
 
 
417 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  49.64 
 
 
427 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  49.16 
 
 
428 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  48.56 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  48.43 
 
 
431 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  48.04 
 
 
434 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  49.27 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  49.03 
 
 
458 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
458 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  50.12 
 
 
450 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  49.14 
 
 
434 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  47.19 
 
 
448 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  52.28 
 
 
435 aa  348  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  48.19 
 
 
443 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  49.88 
 
 
439 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.09 
 
 
435 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  46.8 
 
 
438 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  48.66 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  47.65 
 
 
429 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  48.76 
 
 
424 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  49.51 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  48.3 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  48.78 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  50.12 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  50.12 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  49.11 
 
 
450 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  49.26 
 
 
442 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  44.01 
 
 
418 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  43.68 
 
 
443 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
419 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
423 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 
421 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.71 
 
 
405 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  41.16 
 
 
413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 
405 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
421 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  41.09 
 
 
1169 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  35.04 
 
 
411 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
422 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
438 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
672 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
419 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
439 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
405 aa  179  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
435 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
422 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  36.27 
 
 
403 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.51 
 
 
423 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
453 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.85 
 
 
650 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
415 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
437 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
437 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
425 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
443 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
443 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
498 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
443 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  32.75 
 
 
442 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
495 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
499 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
443 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
424 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.84 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
405 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
448 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.84 
 
 
426 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
402 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
406 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
420 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
418 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  33.25 
 
 
397 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.69 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
408 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  30.02 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  30.02 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.98 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  30.17 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.39 
 
 
404 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
396 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  30.92 
 
 
784 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  26.71 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>