More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4267 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  82.51 
 
 		 406 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 406 aa  810    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  49.37 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  51.64 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 371 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.31 
 
 		 745 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.13 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.76 
 
 		 745 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.74 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 345 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.88 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1311  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0221221  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  39.46 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  26.4 
 
 		 380 aa  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.32 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.12 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  25.19 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.32 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.14 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 477 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.08 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.08 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.58 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>