More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4454 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  750    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  51.17 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  39.36 
 
 
386 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  46.94 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  23.26 
 
 
379 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
371 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
378 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  27.38 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  29.49 
 
 
468 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  28.57 
 
 
820 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
828 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  27.98 
 
 
820 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2885  glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  31.97 
 
 
935 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  21.05 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  29.51 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.32 
 
 
857 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.62 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.74 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
820 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
820 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  29.12 
 
 
820 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
856 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
856 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  32 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.68 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
431 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
821 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40.58 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
822 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
1032 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.86 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
433 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
487 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  28.65 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>