More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3204 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 408 aa  839    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  32.56 
 
 		 1076 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.42 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.42 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.97 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  28.74 
 
 		 743 aa  63.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  24.09 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01299  putative glycosyltransferase  21.87 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  24.48 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.68 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.8 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.22 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13501  glycosyl transferases group 1  25.84 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.61 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 386 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 828 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0478  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521551  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  28.82 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 821 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.99 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  20.39 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 500 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16521  glycosyl transferases group 1  24.07 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.524889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  30.28 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 1302 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  28.24 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  30.9 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  34.45 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  29.03 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13711  glycosyl transferases group 1  31.54 
 
 		 358 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.193432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.18 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13791  glycosyl transferases group 1  26.01 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0857  a-glycosyltransferase  24.53 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 856 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12651  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  20.83 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 800 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 819 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>