More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1613 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  94.87 
 
 		 409 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  808    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  94.87 
 
 		 409 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  80.2 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  75.37 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  77.26 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 382 aa  332  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  49.49 
 
 		 388 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  50.77 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  45.18 
 
 		 444 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  47.51 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  44.86 
 
 		 418 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  42.39 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  44.5 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  31.73 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  32.16 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 376 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  33.85 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 395 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.33 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 819 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.34 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.96 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.31 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.18 
 
 		 935 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.3 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.32 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  31.09 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>