More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1285 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1656  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.93 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0573  glycosyl transferase group 1  61.93 
 
 
461 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.040919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  54.37 
 
 
366 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  51.63 
 
 
371 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
402 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.4 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.86 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
744 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.82 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.92 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.9 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  28.96 
 
 
820 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
822 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  30.52 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  25.31 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.31 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.25 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  39.35 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.97 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.48 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  29.26 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
819 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  28.17 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.34 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.89 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  18.53 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.28 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.96 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2695  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
821 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
774 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.03 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>