More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4741 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  87.66 
 
 
431 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
409 aa  803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  75.62 
 
 
409 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  75.37 
 
 
409 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  75.62 
 
 
409 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  74.49 
 
 
428 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  51.55 
 
 
379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  44.34 
 
 
444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  48.71 
 
 
382 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  46.49 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  44.84 
 
 
418 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  46.97 
 
 
432 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 
434 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  44.22 
 
 
379 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
383 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
387 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  28.27 
 
 
358 aa  166  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
374 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  32.56 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
372 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
374 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  34.01 
 
 
370 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
376 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
335 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  32.61 
 
 
376 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
396 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
482 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
395 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.53 
 
 
480 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.12 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
379 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
448 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
425 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  26.5 
 
 
383 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  34.93 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.99 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  31.56 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  30.7 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.02 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.15 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0824  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.498308  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.38 
 
 
650 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.89 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
370 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0811  glycosyl transferase  23.8 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.115304  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
818 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  24.54 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>