More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2958 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
366 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  89.07 
 
 
366 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  64.03 
 
 
375 aa  472  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  49.32 
 
 
375 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
390 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
390 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  33.59 
 
 
391 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
395 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
388 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
394 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
360 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
395 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
405 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.59 
 
 
405 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
398 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
374 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
372 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
373 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
904 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
457 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.45 
 
 
403 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.84 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
377 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
417 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
452 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
407 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.73 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
458 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  27.14 
 
 
421 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>