118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0640 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 418 aa  820    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  44.86 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  44.84 
 
 		 409 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  45.29 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  29.01 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 344 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  21.63 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  28.7 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  27.16 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3900  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  28 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.02 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.48 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1789  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.13 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  34.69 
 
 		 590 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  24.7 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  26.81 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4054  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.13 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  21.36 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.87 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  24.35 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  22.49 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.39 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.88 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.73 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  21.76 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>