44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4054 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4054  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 438 aa  867    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3034  glycosyl transferase, group 1  47.58 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3900  glycosyl transferase group 1  41.96 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2458  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  20.96 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.63 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  24.6 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.16 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  28.07 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  35.56 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  26.12 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.97 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 339 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.74 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 372 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  20.22 
 
 		 345 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>