More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0766 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
339 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  50.89 
 
 
339 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  50.59 
 
 
339 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.34 
 
 
249 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  45.16 
 
 
342 aa  255  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 
343 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
345 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.49 
 
 
819 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2464  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
550 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  36.84 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.2 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  29.85 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
439 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.95 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.56 
 
 
650 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
423 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
386 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  34.19 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
414 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.98 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
743 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
420 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
420 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
391 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
410 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
410 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  22.7 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
393 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
405 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
405 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
411 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
347 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
903 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
395 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  40.78 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  33.1 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  20.39 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
412 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
412 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.33 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
422 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>