More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0315 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 339 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  90.56 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  50.89 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.03 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 		 342 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  28.66 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  26.25 
 
 		 819 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.75 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.67 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1614  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.34 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2464  hypothetical protein  44.93 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  25.59 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 765 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  19.8 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.22 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  25.86 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.23 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  22.46 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.76 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.34 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  26.34 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  19.93 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.62 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.33 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  35.87 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.81 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 768 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 421 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 828 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>