More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2463 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
249 aa  493  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  67.34 
 
 
339 aa  331  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  52.03 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  50.81 
 
 
339 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  44.83 
 
 
342 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  39.5 
 
 
343 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
345 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 
359 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.77 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
403 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
346 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  40.44 
 
 
411 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.73 
 
 
408 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  40.44 
 
 
411 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
463 aa  62  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
382 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
401 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 
419 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
442 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
410 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
407 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
393 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
404 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
378 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
405 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
403 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
414 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
424 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
377 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
384 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
440 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
380 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
366 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.67 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
439 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
406 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
386 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
368 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25 
 
 
401 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
378 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  31.1 
 
 
384 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
414 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
403 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  30.51 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
379 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
378 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
376 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  28.39 
 
 
371 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
382 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.95 
 
 
419 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
404 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 
371 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
378 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
377 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
380 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
378 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
378 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
362 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  35.9 
 
 
349 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  40.2 
 
 
360 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
362 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
414 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
345 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.2 
 
 
387 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  32.12 
 
 
819 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
394 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
347 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.2 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  30.51 
 
 
381 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
378 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
384 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
354 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
382 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
365 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
410 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
439 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  26.09 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.14 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 
385 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 
385 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>