More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0333 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 339 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  90.56 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  50.59 
 
 		 339 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.81 
 
 		 249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  37.94 
 
 		 343 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  39.58 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  26.67 
 
 		 819 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.94 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.09 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.11 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 402 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2464  hypothetical protein  44.93 
 
 		 84 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  25 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.21 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  25.39 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  20.86 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.22 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1614  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  25.12 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.81 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.66 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.76 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.29 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  20.92 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 704 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.84 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  20.46 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 439 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 440 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  20.33 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>