More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2586 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  58.44 
 
 
384 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
388 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  31.41 
 
 
415 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
399 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
389 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
389 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  31.44 
 
 
393 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.87 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.87 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
402 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
390 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  27.82 
 
 
392 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
411 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  27.32 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.5 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
390 aa  126  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
396 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
400 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.66 
 
 
388 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
389 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  30.92 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
383 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
391 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
395 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
377 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  27.3 
 
 
375 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
391 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
395 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
384 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
376 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  27.76 
 
 
370 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
401 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.64 
 
 
404 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
346 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
379 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.25 
 
 
374 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.25 
 
 
374 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.25 
 
 
374 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  25.33 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.75 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.55 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.8 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.87 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.07 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
395 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  24.88 
 
 
378 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.32 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
394 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  24.18 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.06 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.66 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
400 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
377 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  24.37 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.19 
 
 
388 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
401 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
391 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
386 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
410 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.95 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.49 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
397 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
398 aa  87  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
406 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.94 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>