More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4579 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 376 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.08 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.08 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  26.58 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.54 
 
 		 415 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  27.8 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.75 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 536 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 413 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  23.38 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  31.21 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  27.93 
 
 		 429 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.62 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  27.54 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 904 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1777  group 1 glycosyl transferase  35.29 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.05 
 
 		 935 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.61 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  26.67 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>