More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4073 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
377 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  29.72 
 
 
390 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
379 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
384 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.93 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
376 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
379 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
389 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
389 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
390 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
400 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.69 
 
 
415 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
394 aa  92.8  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  27.78 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  31.95 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  29 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  36.67 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.83 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.68 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  28.74 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.88 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.54 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.5 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0758  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  32.19 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
453 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
363 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.07 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.82 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
409 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2434  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0597525  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>