More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1688 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
400 aa  826    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
384 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
378 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
379 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  29.77 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
396 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
398 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
398 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
388 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
399 aa  156  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  30.6 
 
 
393 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
389 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
394 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
411 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.35 
 
 
415 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
390 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  29.01 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
417 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
384 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  25.39 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
384 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
402 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.5 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
395 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  23.9 
 
 
359 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
406 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
404 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
404 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  26.79 
 
 
404 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
377 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
385 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
390 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.63 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
386 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
477 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
413 aa  89.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
396 aa  89.7  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.71 
 
 
935 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  21.69 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.78 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.23 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.38 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  28.44 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.96 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>