More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0253 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  58.44 
 
 
384 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
388 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.87 
 
 
415 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
398 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
396 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
402 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  31.79 
 
 
392 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
411 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.77 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
417 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
390 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  28.42 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
395 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
376 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
378 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
406 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.44 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
385 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
400 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
395 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
389 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
385 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  26.61 
 
 
390 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
391 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.16 
 
 
383 aa  99.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
391 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  25.25 
 
 
359 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.5 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.34 
 
 
935 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.12 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
417 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.72 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
376 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.37 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
399 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.13 
 
 
382 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.75 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  26.9 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.5 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  26.04 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
414 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.36 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  24.32 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  23.94 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
756 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>